綿陽市傳染病防治中心于1996年經四川省衛生廳批準設立在我院的市級醫療中心，掛靠四川綿陽四〇四醫院，系綿陽市市級唯一傳染病定點治療機構，現有兩個病區（四〇四醫院傳染病區和豐谷病區），設置病床200張。擁有主任醫師6名、副主任醫師10名、主治醫師15名，碩士研究生導師2人，碩士8名。 

該中心擁有西門子64排128層CT、西門子1.5T超導磁共振、西門子平板DSA、美國產單光子發射斷層掃描儀(SPECT)、美國產數字化X線攝像系統（CR）、進口高檔彩色多普勒超聲診斷儀,人工肝支持系統、肝病治療儀、呼吸機、心電監護儀等醫療設備。開展了結核桿菌的培養，HBV-DNA定量及乙肝三對定量的檢測；肝組織學檢查；纖支鏡的診斷及治療技術；肝硬化病人的腹水濃縮回輸治療；流行性出血熱、霍亂少尿期的血液透析；經股動脈插管介入治療肝癌人及介入治療肺結核大咯血；人工肝支持系統治療重型肝炎等診療技術。其中，開展的肝病、結核病等傳染性疾病診療項目在川西北地區達領先水平；開展的人工肝治療，極大地提高了重癥肝病的搶救成功率。 

該中心承擔了綿陽市重大傳染病醫療救治任務，成功處置了“非典”、甲型H1N1流感、重癥手足口病等重大傳染病疫情。先后榮獲中共四川省委、四川省人民政府“四川省非典型肺炎防治工作先進集體”、四川省衛生廳“全省結核病防治工作先進集體”等榮譽稱號。2002年被衛生部授予“衛生部肝炎防治健康教育計劃實施基地”；2012年被國家中醫藥管理局授予“全國中醫藥防治傳染病臨床基地”。該中心全體醫護工作者，本著全心全意為患者服務的宗旨，以科學、認真、負責的態度做好每一項醫療工作，為減輕廣大患者的疾苦盡心、盡力、盡職、盡責。